口袋妖怪火红802版本中神兽的分布位置较为分散，需要玩家掌握特定区域的探索方法。火焰鸟作为火属性神兽固定刷新在火焰山山顶，该地点通过地图可直接定位，但挑战时建议携带水系宝可梦利用属性克制优势。急冻鸟位于双子岛深处，需通过推石堵住瀑布的机关才能进入隐藏洞穴，其等级约60级且具备强控场能力。冰神柱同样出现在双子岛滑冰场区域，需完成特定滑行路线触发出现。幽灵塔顶层的吉拉奇需要突破多层关卡与暗器陷阱才能遭遇，而洛奇亚则出现在第八座彩虹岛右下角草坪，等级高达80级需组建强力队伍应对。
华蓝洞窟是超梦的栖息地，作为超能力系传说宝可梦，其出现需完成红蓝宝石任务链并解锁隐藏区域。雷公、炎帝、水君三圣兽在击败四大天王后，会随机出现在关东地区不同草丛中，其中雷公为电系且初始遭遇等级50级。迪奥西斯需在第九座彩虹岛完成拼图谜题后出现，等级较低但形态特殊。灯火山内部存在古拉顿的捕捉点，而玛纳霏等幻兽则需使用超级钓竿在特定水域垂钓。部分神兽如基格尔德在1号公路有10%遭遇概率，但需要携带喷雾道具提升效率。
黄金喷雾剂能有效提高稀有宝可梦出现率，队伍首位建议放置49级以上宝可梦以匹配神兽等级区间。急冻鸟的推石顺序需遵循上→右→下→左的步骤，错误操作会导致机关重置。对战时应将神兽血量压制至红色状态，配合睡眠或冰冻异常状态可大幅提升捕获成功率。若没有大师球，持续战斗30回合后使用时间球的效率会超过高级球。野生原野区水面可能遭遇蓝圣菇，而紫苑镇精灵塔顶层则栖息着骑拉帝纳。
双子岛区域存在多重神兽线索，除急冻鸟外还能通过超级钓竿获取盖欧卡。灯火山内部结构复杂，红宝石所在层可遇到比克提尼，第三层则分布着捷克罗姆与雷希拉姆。二岛教授御三家终极技能的场所附近会出现代拉基翁，三云神中的雷电云常出没于华兰洞窟入口海面。真新镇南面海域使用超级钓竿可能钓到菲欧娜，该宝可梦可进化为玛纳霏。部分神兽如卡璞家族需在特定草丛配合等级喷雾才能触发遭遇。
遗迹山谷区域隐藏着横向排列的七座特殊遗迹，正常进入时内部为空置状态。需先前往山谷中间洞穴完成推石填坑谜题，才能使遗迹内出现未知图腾群。诞生之岛的迪奥西斯捕捉机制与漆黑魅影版本相似，需正确踩踏黑色石板触发。洛奇亚除彩虹岛固定点位外，21号航道也有概率遭遇。冰系神兽普遍弱火系与格斗系，而超能力系神兽则建议用恶系宝可梦应对。闪光宝可梦的出现概率在该版本有所提升，但神兽的闪光形态仍需极高运气。
